南京生物医药谷地处南京西北部，长江北岸，国家级南京高新技术开发区内，是高新区专业特色子园区。其前身分别历经江苏省“三药”示范基地、江苏省南京新药创业服务中心、江苏省生物医药产业集聚区等阶段。2010年，南京市委、市政府明确了以南京高新区现有的生物医药产业为基础，逐步引导南京市生物医药产业向南京生物医药谷集聚，建设国家生物医药产业基地的发展战略。2011年3月14日南京生物医药谷发展中心成立；同年3月25日，南京生物医药谷建设发展有限公司成立。
